Dom zakonny pw. NMP Matki Kościoła erygowano w 1972 r. Pierwsi dwaj marianie przybyli do Elbląga w roku 1968, by pomagać w duszpasterstwie przy parafii pw. św. Mikołaja, a w dalszej perspektywie zorganizować nową parafię, w której mogłoby zacząć posługę zgromadzenie. W 1971 r. biskup diecezji warmińskiej, do której wówczas należał Elbląg, wydzielił obszar dla samodzielnej placówki duszpasterskiej, związanej z kościołem cmentarnym przy ul. Agrikola.